Традиционное фахитос принято готовить из говядины. Можно использовать также курицу, свинину и морепродукты. Мясо нарезается тонкими полосками и обжаривается на сильном огне на гриле или в сковороде с добавлением масла. За несколько часов до готовки мясо можно замариновать в соке лайма с различными специями. Часто к мясу добавляют приправу «фахита» на основе смеси разных видов перца, чесночного и лукового порошка, кукурузного крахмала, соли и других компонентов. Некоторые кулинары добавляют в жарящееся мясо текилу и поджигают его. К столу мясо подается горячим, чаще всего в сковороде, в которой оно готовилось. Вместе с мясом в отдельных емкостях подаются и другие ингредиенты: нарезанные овощи (свежие или обжаренные), грибы, сыр, различные соусы и заправки, зелень, сметана и тортильи. Особенностью фахитос является то, что каждый сам за столом выбирает себе начинку, которую завернуть в лепешку. Этим оно и отличается от таких блюд мексиканской кухни, как буррито или энчилада, которые подаются уже завернутыми. Идеальными соусами для фахитос считаются острая «сальса» из перца чили, «гуакамоле» из авокадо и «пико-де-гайо» из свежих помидоров, лука и перца чили. Есть фахитос принято руками.