Лепешки для традиционной энчилады готовят по рецепту, который был придуман ацтеками много лет назад. За основу берется кукурузная, реже пшеничная мука. К ней добавляются соль, вода и свиной жир, чтобы тортильи не потрескались при скручивании. Жир можно заменить на маргарин или сливочное масло. Жарить лепешки принято на большом глиняном круге или плоской сковороде без использования масла. Наиболее распространена в Мексике «красная энчилада». Свое название она получила благодаря красноватому цвету лепешки, который получается из-за добавления в тесто красного перца чили. Начинку для этой энчилады готовят из курицы и мягкого белого сыра «панела». Если в тесто добавить сладкую паприку, то цвет тортильи будет более оранжевым. Такой вариант предпочитают жители северной части страны. Начинку для энчилады можно приготовить практически из любых продуктов. Чаще всего это вареная курица или другое мясо, овощи, сыр, яйца и красная фасоль. Обязательно в начинку добавляется острый соус. Наиболее распространены «красная сальса» и «зеленая сальса». Любят в Мексике и «пьяную сальсу боррача» на основе пива. Если энчилада получилась слишком острой, то можно подать ее со сметаной, которая смягчит вкус.